黃律 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院
翟少倫等在檢測中國PBoV時(shí)發(fā)現(xiàn)， PBoV在有呼吸道癥狀的斷奶仔豬中流行最高，但是在斷奶前和死產(chǎn)的仔豬以及成年的種公豬、母豬中流行率較低。這說明斷奶仔豬對PBoV易感，而成年豬不易感。Shan等在檢測PBoV1和PBoV2時(shí)選取了90日齡以下的小豬，感染率在45%-75%。
2010年翟少倫等克隆了PBoV的部分VP1/VP2基因，經(jīng)過序列比對及進(jìn)化樹分析表明其同源性很高（99%~100%）。Zeng等畜牧研究人員在對中國檢測到的PBoV進(jìn)行全序列分析后發(fā)現(xiàn)：PBoV 在核苷酸水平上與CnMV相似性為52–55 %，與BPV相似性為44–45 %，與GBoV 為50%以及和 HBoV為44–48 %，表明PBoV與 CnMV 更為接近。在氨基酸水平上PBoV的NS1蛋白與CnMV的NS1蛋白的相似性為42–43 %，與BPV相似性為 30–35 %，以及和 HBoV 為38–42 %；NP1蛋白與CnMV的NP1蛋白的相似性為37–40 %，與BPV為35–36 %， 和HBoV相似性為 28–36 %；VP1/VP2蛋白和CnMV的VP1/VP2蛋白相似性為44–45 %，與BPV 為30–33 %，與HBoV為 33–36 %。
Cheng等在發(fā)現(xiàn)了新型豬博卡病毒PBoV1和PBoV2，PBoV1和PBoV2之間的核苷酸相似性為94.2%。PBoV1和PBoV2的NS基因與CnMV、BPV (M14363)和 HBoV (DQ000495)相似性分別為45.0–45.2%、36.8–37.4%和42.2–43.1%；其NP基因與CnMV、BPV (M14363)和 HBoV (DQ000495)的相似性為45.1–48.9% 41.7–42.2%和45.2–47.4%；VP基因的相似性分別為 56.5–56.8%、45.9–47.0%和 51.7–51.8%豬博卡病毒6V、7V與PBoV1、PBoV2之間的相似性僅為53.9–55.6%和41.9–43.3%。6V和7V 的VP1蛋白在氨基酸水平與MVC相似性為45.4–45.7%，與BPV相似性為44.1–44.5%與HBoV 相似性為43.1–43.3%；6V和7V 的NP1蛋白在氨基酸水平與PBoV1 和PBoV2相似性為33.1–35.6%，與PBoV-like的相似性為47.3–49.2%。
Cheung等獲得的PPV4全序列進(jìn)行分析后發(fā)現(xiàn)：PPV4的ORF1(NS)序列與BPV2的相似性最高，達(dá)到45.8%，與PBoV-like的NS序列的相似性僅為24.8–33.5%；PPV4的ORF2（VP）序列與BPV2的相似性最高，在氨基酸水平達(dá)到了24.5%的相似性，與PBoV-like的VP序列的相似性僅為18.7–20.3%；PPV4的ORF3(NP)序列不與任何序列有較高的相似性，其與PBoV-like的NP序列的相似性僅為4.9–11.2%。而張宏彪等對已經(jīng)公布的各類博卡病毒全序列進(jìn)行遺傳分析，認(rèn)為動物博卡病毒相當(dāng)離散，而人博卡病毒則相對集中。
總之，已經(jīng)獲得6種博卡之間有聯(lián)系，但是還是相差很大，不管從全基因組序列比較還是各個ORF分開進(jìn)行比較，特別是PPV4，則是遠(yuǎn)離動物博卡病毒的特殊一類。
