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豬流感病毒基因結(jié)構(gòu)與編碼蛋白

發(fā)布時(shí)間:2012-04-24 06:00    作者:yizhiinfo    來源:畜牧人才網(wǎng)    查看:
趙紅梅 吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)

    豬流感病毒(SIV)屬于單股負(fù)鏈RNA病毒,基因組約為13.6Kb,由大小不同的8個(gè)獨(dú)立片段組成,其中片段1和片段2最大,為2341個(gè)核普酸,分別編碼不同長度的PBI和PBZ。片段3一6分別編碼PA、HA、NP和NA。片段7有3個(gè)閱讀框,編碼基質(zhì)蛋白(Ml、MZ和M3)。片段8最小,僅有890個(gè)核昔酸,該片段有2個(gè)開放閱讀框,分別編碼Nsl和NSZ。SIV的8個(gè)基因片段編碼10種蛋白質(zhì)。

    HA是病毒表面的釬突糖蛋白之一,分子量約為76KD,大約有562一566個(gè)氨基酸組成。HA含有4個(gè)結(jié)構(gòu)域:信號膚、胞漿域、跨膜域和胞外域。HA由重鏈HAI和輕鏈HAZ組成,HAI大約由 319一328個(gè)氨基酸組成,具有與受體細(xì)胞受體結(jié)合的特性;HAZ大約有221一222個(gè)氨基酸組成,是參與細(xì)胞融合的重要亞單位。HAI和HAZ由一個(gè)精氨酸相連接,HA以三聚體的形式鑲嵌在雙層類脂膜上,每個(gè)HA單體可分成兩部分,一部分由HAI構(gòu)成的球形頭部,含有受體位點(diǎn)和抗原決定簇;另一部分為柄,由HAI一部分和整個(gè)HAZ組成,插入囊膜。SW的HA受體結(jié)合部位呈口袋狀且相當(dāng)?shù)谋J?,此部位周圍的氨基酸也相?dāng)?shù)谋J兀羰荏w位點(diǎn)上的某個(gè)氨基酸有變異,不僅能夠引起抗原性變異,還能改變受體與病毒的結(jié)合能力。

    病毒能在宿主體內(nèi)傳播的條件是因?yàn)镠A的裂解活性,裂解活性與兩類蛋白酶有關(guān),一種是胰蛋白酶,能同時(shí)裂解高低兩種致病力的毒株的HA,另一種是枯草桿菌酶,它只能裂解高致病力毒株,且在體內(nèi)廣泛存在,在大部分組織內(nèi)復(fù)制,引起大范圍的損傷。HA有重要的功能:能凝集紅細(xì)胞,在病毒吸附和穿膜過程中起重要作用,HA還可誘導(dǎo)機(jī)體產(chǎn)生中和性的抗體以中和病毒的感染,是流感病毒最為重要的保護(hù)性抗原,它既能誘導(dǎo)機(jī)體產(chǎn)生特異性的抗體,又能刺激機(jī)體產(chǎn)生細(xì)胞毒性T淋巴細(xì)胞反應(yīng)(CTL)。HA蛋白含有很多種糖類,這些糖分子的側(cè)鏈可覆蓋糖基化位點(diǎn)和氨基酸殘基,所以糖基化位點(diǎn)對病原的抗原性和生物特性有影響。低致病性毒株裂解位點(diǎn)處只有一個(gè)堿性氨基酸,而高致病力的毒株含有多個(gè)堿性氨基酸。

    NA是構(gòu)成病毒囊膜釬突之一,屬于H類糖蛋白,包含4個(gè)結(jié)構(gòu)域:氨基酸胞漿尾、非極性跨膜區(qū)、頸部以及頭部序列。在檢測不同的亞型中,胞漿尾的氨基酸序列是一樣的。NA有一個(gè)疏水區(qū),6個(gè)氨基酸比較保守,其他的氨基酸變異大,SIV的頭部相對的保守,不同亞型有很高的同源性,NA頭部的n個(gè)保守氨基酸構(gòu)成了NA的酶活性中心。NA能水解紅細(xì)胞表面受體,使凝集到紅細(xì)胞的病毒解脫下來,或從感染的細(xì)胞中釋放出來。另外,NA可以阻止病毒粒子的吸附,并增強(qiáng)病毒粒子的釋放。最近的研究表明,NA吸附的牢固程度和活性的發(fā)揮,關(guān)系到病毒能否以最佳的方式進(jìn)行復(fù)制。

    核蛋白(NP)由片段5編碼,大約為500個(gè)氨基酸。NP是核蛋白,具有型特異性,NP是螺旋形核衣殼的主軸,與RNA片段和各種聚合酶相連,在感染的細(xì)胞中以磷酸化形式存在。NP至少有3個(gè)互相重疊的抗原區(qū),其中一個(gè)區(qū)在各型流感病毒間均存在。

    針對這一區(qū)的單克隆抗體可以抑制病毒RNA的轉(zhuǎn)錄,說明NP在mRNA到RNA轉(zhuǎn)錄過程中起著重要的作用。NP的核普酸比較保守,但有時(shí)也會(huì)發(fā)生突變?;|(zhì)蛋白(Ml和M2)由片段7編碼,為疏水性蛋白,由250個(gè)氨基酸組成,有3個(gè)讀碼框,能夠誘導(dǎo)病毒的組裝,Ml在不同的階段感染細(xì)胞,其所表現(xiàn)出的功能也有所不同。在病毒成熟脫殼時(shí),釋放核糖核蛋白;在細(xì)胞感染是,Ml與核糖核蛋白結(jié)合,使其自細(xì)胞內(nèi)轉(zhuǎn)移到核外。MZ的氨基酸最保守,為非糖基的跨膜蛋白,以四聚體形式組成寡聚體,存在感染細(xì)胞的表面。MZ在感染細(xì)胞時(shí)作為質(zhì)子通道,一方面控制高爾基體的PH值,保證HA的完整性;另一方面在病毒粒子脫殼時(shí),形成酸化環(huán)境,激活HA的功能。

    聚合酶蛋白PA、PBI和PBZ由病毒片段l、2和3編碼,分別由720,760和760個(gè)氨基酸組成。3個(gè)聚合酶蛋白與病毒的核蛋白相連接,構(gòu)成病毒的聚合酶復(fù)合體,具有轉(zhuǎn)錄核酸內(nèi)切酶的活性。其中PBZ識別和裂解宿主細(xì)胞mRNA端帽子結(jié)構(gòu),以此可作為病毒轉(zhuǎn)錄的引物;PBI具有可使模板mRNA不斷延長的作用;PA是一解鏈蛋白,具有蛋白激酶的活性。

    非結(jié)構(gòu)蛋白(NS)有兩個(gè)開放閱讀框,分別編碼Nsl和NSZ,分子量分別為25KD和12KD。NSI是線性mRNA編碼產(chǎn)物,有202一207個(gè)氨基酸,NSI蛋白含有2個(gè)核定位信號區(qū)。NsZ由剪接的mRNA轉(zhuǎn)錄而來,有121個(gè)氨基酸。序列分析,NSI和NsZ有70個(gè)氨基酸重疊。NSI主要存在感染細(xì)胞的核內(nèi),NSZ存在于感染細(xì)胞內(nèi)。NSI分子的氨基酸殘基和磷酸基團(tuán)共價(jià)連接,磷酸化的Nsl蛋白可調(diào)節(jié)病毒復(fù)制過程。NSI的功能是抵抗宿主細(xì)胞產(chǎn)生千擾素的活性。NSI還具有調(diào)節(jié)功能,NSI還可以調(diào)節(jié)病毒mRNA的轉(zhuǎn)錄和復(fù)制,例如病毒mRNA的剪切,促進(jìn)病毒RNA的翻譯等。NSZ蛋白大量存在于宿主細(xì)胞的細(xì)胞漿中,其合成較晚。病毒粒子中含有NSZ蛋白。

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