廉傳江 吉林大學(xué)
與線蟲、果蠅、人和小鼠等模式生物相比較來看，有關(guān)畜禽 miRNA 的研究起步相對較晚，目前在 miRBase 數(shù)據(jù)庫中記錄的豬、牛、雞和羊等畜禽的 miRNA數(shù)量遠(yuǎn)遠(yuǎn)少于人和小鼠等其他物種?？傮w而言，對畜禽 miRNA 的研究只是剛剛起步，但近年來也取得了一定的研究進(jìn)展。目前，畜牧動物 miRNA 研究中取得的最令人激動的成果無疑是對多薩特羊高產(chǎn)肉性狀分子機理的揭示。Alex Clop等人發(fā)現(xiàn)，Texel 綿羊中的 GDF8 基因的 3′UTR 內(nèi)的一個點突變產(chǎn)生了一個在骨骼肌內(nèi)高度表達(dá)的兩個 miRNAs（miR-1 和 miR-206）的作用位點，從而引起了 miRNA 介導(dǎo)的 myostatin 蛋白的表達(dá)量下降而造成 Texel 綿羊肌肉過度肥大。
在豬中，Wernersson 等人于 2005 年利用鳥槍測序法結(jié)合基因組比對分析首次鑒定了 54 個豬的 miRNA。2008 年，Sharbati-Tehrani 等利用一種新的串聯(lián)并克隆 miRNA 的聚合 PCR 方法發(fā)現(xiàn)了 10 個新的豬 miRNAs。Huang 等與McDaneld 等人先后分別利用基因芯片與第二代高通量測序技術(shù)對豬肌肉發(fā)育過程 miRNA 的表達(dá)譜進(jìn)行了研究，他們均發(fā)現(xiàn)了 3 個已知的肌肉 miRNAs，miR-206，miR -133 和 miR-1，同時表明這些 miRNA 具有保守的功能，因為在其他物種中已經(jīng)發(fā)現(xiàn)它們參與調(diào)節(jié)肌肉發(fā)育過程。
最近，454 生命科學(xué)測序技術(shù)被用于鑒定在豬心、肝、胸腺三種組織中表達(dá)的 miRNA，該表達(dá)譜分析鑒定了 120個與其他物種已知同源的 miRNAs，表明豬的基因組可能編碼幾百個 miRNAs，其中仍有許多有待進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)。目前已鑒定的豬 miRNA 的數(shù)量仍相對較少，原因是豬的基因組序列不完整，這將阻礙 miRNA 的生物信息學(xué)預(yù)測與實驗驗證。對于 miRNA 的發(fā)現(xiàn)來說，準(zhǔn)確的基因組定位是必不可少的。因為判定一個序列為可能 miRNA 的一個標(biāo)準(zhǔn)是其側(cè)翼序列能夠形成一個發(fā)夾二級結(jié)構(gòu)。
大多數(shù)牛的 miRNA 是通過同源搜索方法發(fā)現(xiàn)的，目前在 miRBase 數(shù)據(jù)庫中登記了 334 個牛 miRNA，其中 100 個通過了測序驗證。2007 年，Gu 等人從牛的脂肪和乳腺組織中鑒定了將近 60 個 miRNAs，其中 5 個是在哺乳動物中首次發(fā)現(xiàn)的。另外，Strozzi 等利用生物信息學(xué)方法又鑒定了 249 個牛 miRNAs。目前其他反芻類動物的 miRNA 鑒定還很少，最近一個關(guān)于山羊和綿羊皮膚與毛囊的表達(dá)譜研究鑒定了 159 個羊 miRNAs，其中 105 個在兩品種中均有表達(dá)，表明在反芻類物種中 miRNA 具有相似的表達(dá)。
Xu 等從成雞和雞胚中共克隆了 25 個 miRNA，新發(fā)現(xiàn)了 miR-757。Darnell等利用高通量原位雜交技術(shù)，對 135 個 miRNA 在雞胚胎中的表達(dá)情況進(jìn)行了檢測，其中 84 個在 5 天前的胚胎中能夠檢測到。Glazov 等利用 Solexa 高通量測序技術(shù)從 E5、E7、E9 天雞胚胎中共檢測出 361 個新 miRNA。最近，Hicks 等利用高通量測序技術(shù)進(jìn)行 miRNA 表達(dá)譜分析，在雞 E11 胚胎中鑒定了大約200 個 miRNAs。
