徐越 四川農(nóng)業(yè)大學(xué)
細菌分類鑒定方法由表型鑒定，生理生化鑒定和分子生物學(xué)鑒定構(gòu)成。傳統(tǒng)的表型鑒定和生理生化鑒定有一定的局限性，而分子生物學(xué)鑒定方法的建立為細菌的鑒定提供了更為可靠的依據(jù)。微生物的核糖體本身由蛋白質(zhì)和核酸分子組成，分成大小兩個“亞基”。它們大約2/3的重量是核酸分子，1/3是蛋白質(zhì)。細菌核糖體小亞基的骨架是一條稱為 165rRNA的核酸分子。1970年代后期，美國伊利諾大學(xué)的沃斯(CarlR.woese)及合作者，建議把核糖體小亞基的核酸序列當作分子鐘，從中提取進化信息。按照這一思路進行的分子進化研究，取得了很大成功。
細菌的rRNA含有3種類型:235、165、SSrRNA，其中165長度適中，信息量較大且易分析。而16SrRNA所對應(yīng)的16SrDNA(編碼16SrRNA亞基的基因)的區(qū)域中既有保守區(qū)，又有可變區(qū)，適合于用于細菌屬，種間的鑒定，被認為是衡量生命進化最理想的標尺。
目前有很多用16SrDNA對細菌進行分離鑒定的相關(guān)報道。龔漢雨，程國軍對一株抗鉻細菌進行了形態(tài)學(xué)觀察和生理生化鑒定以及 165rDNA序列分析，將其鑒定為為巨大芽抱桿菌。潘康成，馮興用細菌通用引物，對兩株細菌的16SrDNA片段進行了擴增，并將兩株菌鑒定為枯草芽抱桿菌和蠟樣芽抱桿菌。吳擁軍等依據(jù)雙歧桿菌 165rDNA保守序列設(shè)計屬特異性引物，對其165:DNA進行擴增，建立了相應(yīng)快速、可靠的雙歧桿菌基因組DNA的提取方法和PCR擴增體系。這種快速、可靠的鑒定方法能夠有效的檢測食品及微生態(tài)制劑中的雙歧桿菌。靳鴻蔚，劉桂蘭等從土壤中篩選出一株能降解膠原蛋白的細菌，并通過擴增其16srnNA片段，鑒定其為巨大芽抱桿菌。
