謝飛 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)
動物機(jī)體正常微生物菌群既是具體，又是相對的概念。其定義是:在宿主特定解剖部位，伴隨宿主長期進(jìn)化過程形成的，在宿主一定時期，定殖在宿主勃膜或皮膚上的微生物群。一般生理情況下，主要表現(xiàn)為有益于宿主的微生物群落，但在病理情況下，也可能表現(xiàn)為有害于宿主的微生物群落。
腸道微生物群落可分為三大部分:①與宿主共生的生理性細(xì)菌:為專性厭氧菌，是腸道的優(yōu)勢菌群，如雙歧桿菌、類桿菌、優(yōu)桿菌和消化球菌等是膜菌群的主要構(gòu)成者，具有營養(yǎng)及免疫調(diào)節(jié)作用;②與宿主共棲的條件性致病菌，以兼性需氧菌為主，為腸道非優(yōu)勢菌群，如腸球菌、腸桿菌，在腸道微生態(tài)平衡時是無害的，但在特定的條件下具有侵襲性，對機(jī)體有害;③病原菌:多數(shù)為過路菌，長期定植的機(jī)會少，腸道微生態(tài)平衡時，這些微生物的數(shù)量少，不會致病，如果數(shù)量超出正常水平，則可引起機(jī)體發(fā)病，如變形桿菌、假單胞菌和韋氏梭菌等。
人體營養(yǎng)學(xué)研究表明，成人腸道中約有500一1000種菌群寄生，數(shù)量達(dá)到10’2一10’4個，不僅遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過人體表皮微生物的數(shù)量，而且是人體自身細(xì)胞數(shù)目的10倍，由于微生物數(shù)量巨大，消化道可以形象地認(rèn)為是地球上生物定植密度最高的生態(tài)系統(tǒng)之一，菌群之間以及菌群與宿主之間，形成了相互依存、相互作用的不可分割的整體。
前人研究通常將腸道微生物群落與宿主的關(guān)系歸納為共棲(一個種類受益，而另一個種類不受影響)或互惠共生(兩個種類都受益)。然而，“共棲”并不能準(zhǔn)確地描述腸道微生物群落個體對于其他個體或人體的有益作用;現(xiàn)在，許多研究者將宿主腸道內(nèi)微生物群落看作是宿主的一個器官，這主要是因?yàn)?微生物群落由多種細(xì)胞系組成，細(xì)胞間或細(xì)胞與宿主之間具有信息交流能力;能夠消耗、貯藏和重新分配能量;參與調(diào)控一些重要的化學(xué)轉(zhuǎn)換過程;同時通過自復(fù)制來維持和修復(fù)自身研究也表明:人體腸道微生物群落基因組(微生物組)中包含的基因數(shù)目大概是人體自身基因數(shù)目的百倍以上。因此，越來越多的研究者將人視為由人體和相關(guān)微生物共同組成的“超生物”，從人體自身基因組和微生物組結(jié)合體的角度來進(jìn)行研究。
